Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms