Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms