Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DKK3Q9UBP4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms