Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Pacsin3Q99JB8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Pacsin3Q99JB8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Pacsin3Q99JB8 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Pacsin3Q99JB8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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