Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdcl3Q8BVF2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pdcl3Q8BVF2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pdcl3Q8BVF2 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pdcl3Q8BVF2 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdcl3Q8BVF2 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pdcl3Q8BVF2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pdcl3Q8BVF2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Pdcl3Q8BVF2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdcl3Q8BVF2 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pdcl3Q8BVF2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pdcl3Q8BVF2 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms