Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Arhgef17Q80U35 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arhgef17Q80U35 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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