Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL6Q6ICC9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RTL6Q6ICC9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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