Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms