Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CLN3Q13286 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CLN3Q13286 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CLN3Q13286 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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CLN3Q13286 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CLN3Q13286 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CLN3Q13286 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CLN3Q13286 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CLN3Q13286 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CLN3Q13286 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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