Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TspoP50637 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TspoP50637 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
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TspoP50637 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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TspoP50637 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TspoP50637 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TspoP50637 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TspoP50637 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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TspoP50637 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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TspoP50637 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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TspoP50637 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TspoP50637 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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TspoP50637 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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TspoP50637 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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TspoP50637 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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TspoP50637 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
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