Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa4P06798 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa4P06798 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxa4P06798 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa4P06798 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms