Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sec22bO08547 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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