Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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