Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Subh2bvQ9D9Z7 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms