Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Hoxc12Q8K5B8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Hoxc12Q8K5B8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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