Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tbr1Q64336 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tbr1Q64336 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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