Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc18Q640L5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc18Q640L5 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms