Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PcolceQ61398 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PcolceQ61398 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PcolceQ61398 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PcolceQ61398 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PcolceQ61398 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PcolceQ61398 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PcolceQ61398 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PcolceQ61398 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PcolceQ61398 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PcolceQ61398 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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