Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms