Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Saa4P31532 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Saa4P31532 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Saa4P31532 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms