Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtprcP06800 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtprcP06800 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprcP06800 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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PtprcP06800 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PtprcP06800 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprcP06800 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PtprcP06800 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PtprcP06800 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PtprcP06800 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PtprcP06800 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PtprcP06800 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprcP06800 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms