Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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