Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 C12orf45-201ENST00000280749 459 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SRP9-205ENST00000626563 329 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 HFE-205ENST00000352392 653 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC073316.2-201ENST00000414126 418 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms