Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

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Length 977 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TRPC4Q9UBN4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TRPC4Q9UBN4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TRPC4Q9UBN4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TRPC4Q9UBN4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TRPC4Q9UBN4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TRPC4Q9UBN4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TRPC4Q9UBN4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRPC4Q9UBN4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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