Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms