Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Atxn3Q9CVD2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Atxn3Q9CVD2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Atxn3Q9CVD2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Atxn3Q9CVD2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Atxn3Q9CVD2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Atxn3Q9CVD2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Atxn3Q9CVD2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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