Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM208BQ5VWN6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms