Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms