Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Apoc3P33622 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Apoc3P33622 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms