Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18524 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18524 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18524 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18524 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18524 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18524 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P18524 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18524 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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P18524 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms