Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1Q9UJ41 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms