Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Nectin3Q9JLB9 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Nectin3Q9JLB9 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Nectin3Q9JLB9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Nectin3Q9JLB9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Nectin3Q9JLB9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Nectin3Q9JLB9 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Nectin3Q9JLB9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nectin3Q9JLB9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nectin3Q9JLB9 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms