Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Chmp3Q9CQ10 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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