Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gli3Q61602 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gli3Q61602 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gli3Q61602 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gli3Q61602 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gli3Q61602 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gli3Q61602 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gli3Q61602 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gli3Q61602 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gli3Q61602 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gli3Q61602 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gli3Q61602 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gli3Q61602 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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