Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fam220aQ3ZN08 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fam220aQ3ZN08 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fam220aQ3ZN08 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fam220aQ3ZN08 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fam220aQ3ZN08 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fam220aQ3ZN08 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fam220aQ3ZN08 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Fam220aQ3ZN08 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Fam220aQ3ZN08 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Fam220aQ3ZN08 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Fam220aQ3ZN08 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Fam220aQ3ZN08 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fam220aQ3ZN08 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Fam220aQ3ZN08 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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