Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms