Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL9Q07325 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms