Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fgfr4Q03142 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms