Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab1AP62821 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms