Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCF9

Ssr3, Translocon-associated protein subunit gamma, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr3Q9DCF9 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ssr3Q9DCF9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssr3Q9DCF9 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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