Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ssuh2Q8C3L1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms