Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Snx17Q8BVL3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx17Q8BVL3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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