Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gramd2bQ6PEM6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms