Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Sox19Q62249 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sox19Q62249 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sox19Q62249 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sox19Q62249 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sox19Q62249 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sox19Q62249 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sox19Q62249 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sox19Q62249 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sox19Q62249 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sox19Q62249 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox19Q62249 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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