Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ttc21bQ0HA38 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ttc21bQ0HA38 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ttc21bQ0HA38 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ttc21bQ0HA38 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ttc21bQ0HA38 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ttc21bQ0HA38 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ttc21bQ0HA38 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ttc21bQ0HA38 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ttc21bQ0HA38 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ttc21bQ0HA38 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttc21bQ0HA38 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms