Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SctQ08535 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SctQ08535 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms