Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms