Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srp9P49962 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms