Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Znf346Q9R0B7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Znf346Q9R0B7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Znf346Q9R0B7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Znf346Q9R0B7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Znf346Q9R0B7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Znf346Q9R0B7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Znf346Q9R0B7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Znf346Q9R0B7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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