Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Pgpep1Q9ESW8 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms